没有想到的是这样的局面仅仅维持了不到两个月，朝廷大军的劣势便凸显了出来。
统兵将帅能力远远低于朱棣的燕军将领，在局面大好的情况下，统帅李景隆竟然接连使了几个昏招。错失了大好的局面不说，最终在郑村坝大败与燕军。最后还是监军的锦衣卫千户杨军拼死保护，才带着灰头土脸的李景隆逃回了南京城。
将近六十万大军围剿十万余人，最后功亏一篑。当时朝廷官员都以为小皇帝会杀了李景隆平息怒气，没有想到的是朱允文只是撤掉了他大将军的职务，继续留在京城做了―个闲置官员。
朱允文的心思归不归是明白的，原本当年跟随着太祖皇帝朱元璋打天下的老将，在太祖晚年差不多已经诛杀殆尽了，朱允文其实是无将可用。而朱棣本身就是当年跟随朱元璋大战陈友谅，张士诚，随后和蒙古大军决战的将领。实战经验丰富，朱元璋曾经亲口说过燕王善谋这样的话。
加上朱棣手下陈亨、朱能、丘福和张玉四将勇猛无比，兵卒多是与蒙古人征战多年的士兵。身后还有一个出谋划策的和尚姚广孝，就是这位和尚谋士的出谋划策，让朱棣最后反败为胜之后，大军开始向着南京城逼近。
当初燕王招募姚广孝，是想着借用这位和尚的术法在两军当中出奇制胜。想不到真到了两军开战的时候，这和尚竟然好像自己废了术法一样，从头到尾都没有施展过术法。只是向燕王献计献策，好在他的计策被朱棣采用之后，无不出奇制胜。最后靠着这和尚的计谋，才一次一次的反败为胜。